AFC Unirea 04 Slobozia dispune de o academie bine structurată, cu echipe de juniori la mai multe categorii de vârstă, inclusiv U19, U18, U17, U16, U15, U13, U12, U11, U10, U8 și U7. Aceste echipe concurează în campionatele naționale și județene de juniori, având ca obiectiv nu doar dezvoltarea tehnică și fizică a tinerelor talente, ci și pregătirea acestora pentru a face pasul spre echipa de seniori. De asemenea, clubul deține echipe de fotbal feminin la categoria senioare, Liga a 3-a și junioare U15, U13 și U11.
Academia beneficiază de un corp de manageri și antrenori care coordonează activitatea grupelor mai sus enumerate: Ion Ionescu, Marius Chițoiu, Bogdan Topor, Constantin Prepeliță, Cristea Rusu, Daniel Popa, Diana Gidu, Gigel Stoica, Adrian Cristea, Luseghen Arzumanian, Daniela Ioniță și Ada Ioniță.